忍科院的入口在一处民宅之中，位置藏得十分隐秘，这完全是由大蛇丸独立设计建造的。

事实上忍科院的结构类似于一座塔，只不过这座塔是完全倒立的，建造在地下深处，足足有十几层深，越往下保密级别越高。

而培养尾兽查克拉的地方，便在忍科院的最深处，这里的防卫级别是最高的，只有三个人可以进入，包括纲手

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